Γονίδια και γονιδιώματα

Eclass https://eclass.upatras.gr/courses/MED971/

Συντονιστές: Ζ. Λυγερού

Περιεχόμενο: Οργάνωση και λειτουργία του ανθρώπινου γονιδιώματος, μεταλλάξεις και εξέλιξη, γενετικοί πολυμορφισμοί/παραλλαγές και ποικιλομορφία, QTLs, ανθρώπινη εξέλιξη/σύγκριση γονιδιωμάτων, συσχέτιση γενετικών παραλλαγών με ασθένειες/χαρακτηριστικά/θεραπεία, microbiome

Σύγχρονες μέθοδοι μελέτης βιολογικών συστημάτων (αρχές μεθόδων, τύποι δεδομένων που παρέχουν και τα ερωτήματα που απαντούν): γονιδιωματική ανάλυση, GWAS, Next Generation Sequencing, proteomics, βιολογία συστημάτων/μοντελοποίηση, metagenomics

Βασικοί όροι/έννοιες (που θα πρέπει απαραίτητα να γνωρίζουν ολοι οι φοιτητές στο τέλος του μαθήματος):

Γονιδίωμα, Μοναδιαίες και επαναλλαμβανόμενες αλληλουχίες, μεταθετά στοιχεία, μεταλλάξεις και εξέλιξη, γενετικοί πολυμορφισμοί, Single nucleotide variants/SNPs, copy number variants/CNVs, GWAS, απλότυπος, ομόλογα/ορθόλογα/παράλογα, synteny, EST, NGS, RNASeq, exome sequencing, (+ αναφορά σε microarray analysis, για λίγο ακόμη…), proteomics/mass spec, pharmacogenomics, metagenomics, microbiome

Προαπαιτούμενη γνώση: LSI101: δομή DNA, RNA, πρωτεϊνών, γονίδιο, ροή της γενετικής πληροφορίας, ρύθμιση της γονιδιακής έκφρασης, μείωση και ανασυνδυασμός. ΠΕ101: φάρμακο-στόχος-παρενέργειες

Μορφή διδασκαλίας: παραδόσεις /παρουσιάσεις φοιτητών

Τρόπος εξέτασης: Παρουσιάσεις φοιτητών